Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQB7

Lyrm1, LYR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lyrm1Q9CQB7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lyrm1Q9CQB7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lyrm1Q9CQB7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms