Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP4Q9C0A0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms