Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A4AQ96JQ5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A4AQ96JQ5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms