Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00116Q8NCU8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LINC00116Q8NCU8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms