Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSL3Q8N5Y2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MSL3Q8N5Y2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms