Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc29Q80VM3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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