Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atg16l2Q6KAU8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg16l2Q6KAU8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms