Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AGAP6Q5VW22 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AGAP6Q5VW22 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms