Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STRIP1Q5VSL9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STRIP1Q5VSL9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms