Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FRMPD1Q5SYB0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FRMPD1Q5SYB0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FRMPD1Q5SYB0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms