Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SYPL1Q16563 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms