Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CPSF1Q10570 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
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