Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
CD164Q04900 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
CD164Q04900 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms