Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1BQ00975 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1BQ00975 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms