Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABARAPL2P60520 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms