Protein–RNA interactions for Protein: P53753

DSE4, Endo-1,3(4)-beta-glucanase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE4P53753 snR38snR38 95 nt1.47□□□□□ -2.17
DSE4P53753 MYO1YHR023W 5787 nt1.46□□□□□ -2.18
DSE4P53753 FYV8YGR196C 2454 nt1.46□□□□□ -2.18
DSE4P53753 LAA1YJL207C 6045 nt1.45□□□□□ -2.18
DSE4P53753 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt1.44□□□□□ -2.18
DSE4P53753 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt1.44□□□□□ -2.18
DSE4P53753 HUG1YML058W-A 207 nt1.44□□□□□ -2.18
DSE4P53753 RPL41AYDL184C 78 nt1.43□□□□□ -2.18
DSE4P53753 HKR1YDR420W 5409 nt1.42□□□□□ -2.18
DSE4P53753 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt1.42□□□□□ -2.18
DSE4P53753 YGR130CYGR130C 2451 nt1.42□□□□□ -2.18
DSE4P53753 FIG2YCR089W 4830 nt1.42□□□□□ -2.18
DSE4P53753 NST1YNL091W 3723 nt1.41□□□□□ -2.18
DSE4P53753 NIP1YMR309C 2439 nt1.4□□□□□ -2.18
DSE4P53753 AI1Q0050 2505 nt1.4□□□□□ -2.18
DSE4P53753 PAU12YGR294W 363 nt1.4□□□□□ -2.19
DSE4P53753 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt1.4□□□□□ -2.19
DSE4P53753 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.38□□□□□ -2.19
DSE4P53753 BUL2YML111W 2763 nt1.36□□□□□ -2.19
DSE4P53753 SIP4YJL089W 2490 nt1.36□□□□□ -2.19
DSE4P53753 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt1.36□□□□□ -2.19
DSE4P53753 IML1YJR138W 4755 nt1.35□□□□□ -2.19
DSE4P53753 SPT7YBR081C 3999 nt1.34□□□□□ -2.19
DSE4P53753 CLU1YMR012W 3834 nt1.34□□□□□ -2.19
DSE4P53753 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.34□□□□□ -2.19
DSE4P53753 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.34□□□□□ -2.2
DSE4P53753 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt1.32□□□□□ -2.2
DSE4P53753 SKI7YOR076C 2244 nt1.32□□□□□ -2.2
DSE4P53753 BUD3YCL014W 4911 nt1.31□□□□□ -2.2
DSE4P53753 YER078W-AYER078W-A 165 nt1.3□□□□□ -2.2
DSE4P53753 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.29□□□□□ -2.2
DSE4P53753 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.29□□□□□ -2.2
DSE4P53753 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt1.28□□□□□ -2.2
DSE4P53753 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt1.27□□□□□ -2.21
DSE4P53753 RKR1YMR247C 4689 nt1.27□□□□□ -2.21
DSE4P53753 snR75snR75 89 nt1.24□□□□□ -2.21
DSE4P53753 YER090C-AYER090C-A 90 nt1.2□□□□□ -2.22
DSE4P53753 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.2□□□□□ -2.22
DSE4P53753 YPR117WYPR117W 7470 nt1.1□□□□□ -2.23
DSE4P53753 VAM6YDL077C 3150 nt1.08□□□□□ -2.24
DSE4P53753 YJR029WYJR029W 5268 nt1.07□□□□□ -2.24
DSE4P53753 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.07□□□□□ -2.24
DSE4P53753 BEM2YER155C 6504 nt1.07□□□□□ -2.24
DSE4P53753 PET111YMR257C 2403 nt1.06□□□□□ -2.24
DSE4P53753 snR67snR67 82 nt1.03□□□□□ -2.24
DSE4P53753 SCC2YDR180W 4482 nt1.02□□□□□ -2.25
DSE4P53753 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.01□□□□□ -2.25
DSE4P53753 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.01□□□□□ -2.25
DSE4P53753 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.01□□□□□ -2.25
DSE4P53753 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.01□□□□□ -2.25
DSE4P53753 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.01□□□□□ -2.25
DSE4P53753 PAU24YBR301W 363 nt1□□□□□ -2.25
DSE4P53753 YMR160WYMR160W 2451 nt0.96□□□□□ -2.26
DSE4P53753 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.92□□□□□ -2.26
DSE4P53753 LTE1YAL024C 4308 nt0.89□□□□□ -2.27
DSE4P53753 DOP1YDR141C 5097 nt0.88□□□□□ -2.27
DSE4P53753 YKL106C-AYKL106C-A 120 nt0.85□□□□□ -2.27
DSE4P53753 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt0.83□□□□□ -2.28
DSE4P53753 MLP2YIL149C 5040 nt0.83□□□□□ -2.28
DSE4P53753 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt0.8□□□□□ -2.28
DSE4P53753 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE4P53753 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE4P53753 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE4P53753 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE4P53753 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE4P53753 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE4P53753 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE4P53753 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE4P53753 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE4P53753 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE4P53753 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.79□□□□□ -2.28
DSE4P53753 YML100W-AYML100W-A 174 nt0.72□□□□□ -2.29
DSE4P53753 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE4P53753 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE4P53753 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE4P53753 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE4P53753 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE4P53753 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE4P53753 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE4P53753 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE4P53753 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.71□□□□□ -2.3
DSE4P53753 THO2YNL139C 4794 nt0.7□□□□□ -2.3
DSE4P53753 MLP1YKR095W 5628 nt0.69□□□□□ -2.3
DSE4P53753 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt0.67□□□□□ -2.3
DSE4P53753 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt0.67□□□□□ -2.3
DSE4P53753 IQG1YPL242C 4488 nt0.66□□□□□ -2.3
DSE4P53753 UTP10YJL109C 5310 nt0.66□□□□□ -2.3
DSE4P53753 UTP20YBL004W 7482 nt0.65□□□□□ -2.31
DSE4P53753 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.63□□□□□ -2.31
DSE4P53753 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.61□□□□□ -2.31
DSE4P53753 SOV1YMR066W 2697 nt0.6□□□□□ -2.31
DSE4P53753 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt0.56□□□□□ -2.32
DSE4P53753 snR77snR77 88 nt0.53□□□□□ -2.32
DSE4P53753 YOL014WYOL014W 375 nt0.53□□□□□ -2.32
DSE4P53753 FMP27YLR454W 7887 nt0.53□□□□□ -2.33
DSE4P53753 snR40snR40 97 nt0.47□□□□□ -2.33
DSE4P53753 SBH2YER019C-A 267 nt0.46□□□□□ -2.34
DSE4P53753 ESP1YGR098C 4893 nt0.41□□□□□ -2.34
DSE4P53753 PAU9YBL108C-A 129 nt0.4□□□□□ -2.35
DSE4P53753 snR128snR128 126 nt0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.6 ms