Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOSBP53539 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
FOSBP53539 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOSBP53539 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOSBP53539 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOSBP53539 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOSBP53539 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOSBP53539 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOSBP53539 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOSBP53539 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOSBP53539 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOSBP53539 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOSBP53539 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOSBP53539 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOSBP53539 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOSBP53539 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOSBP53539 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOSBP53539 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOSBP53539 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOSBP53539 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOSBP53539 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOSBP53539 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOSBP53539 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOSBP53539 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOSBP53539 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOSBP53539 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOSBP53539 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOSBP53539 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOSBP53539 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOSBP53539 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOSBP53539 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOSBP53539 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms