Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1P21675 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1P21675 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1P21675 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1P21675 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1P21675 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1P21675 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TAF1P21675 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF1P21675 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF1P21675 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF1P21675 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF1P21675 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF1P21675 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF1P21675 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF1P21675 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF1P21675 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TAF1P21675 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1P21675 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1P21675 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1P21675 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1P21675 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1P21675 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1P21675 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1P21675 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1P21675 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1P21675 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1P21675 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1P21675 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1P21675 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1P21675 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TAF1P21675 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1P21675 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1P21675 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1P21675 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1P21675 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1P21675 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1P21675 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1P21675 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1P21675 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1P21675 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TAF1P21675 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TAF1P21675 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1P21675 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1P21675 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1P21675 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1P21675 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1P21675 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1P21675 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1P21675 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1P21675 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1P21675 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1P21675 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TAF1P21675 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1P21675 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1P21675 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1P21675 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1P21675 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1P21675 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1P21675 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1P21675 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1P21675 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1P21675 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1P21675 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1P21675 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1P21675 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1P21675 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1P21675 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1P21675 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TAF1P21675 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1P21675 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1P21675 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1P21675 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1P21675 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1P21675 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1P21675 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1P21675 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TAF1P21675 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms