Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HOXB1P14653 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXB1P14653 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms