Protein–RNA interactions for Protein: P09690

Chrnb1, Acetylcholine receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb1P09690 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chrnb1P09690 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms