Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GABARAPO95166 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GABARAPO95166 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms