Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NIPSNAP2O75323 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms