Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGSF3O75054 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF3O75054 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms