Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pramef25A2ASI9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pramef25A2ASI9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms