Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mbd1Q9Z2E2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mbd1Q9Z2E2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mbd1Q9Z2E2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd1Q9Z2E2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd1Q9Z2E2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mbd1Q9Z2E2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd1Q9Z2E2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mbd1Q9Z2E2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd1Q9Z2E2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mbd1Q9Z2E2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mbd1Q9Z2E2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mbd1Q9Z2E2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mbd1Q9Z2E2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mbd1Q9Z2E2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mbd1Q9Z2E2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd1Q9Z2E2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd1Q9Z2E2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd1Q9Z2E2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd1Q9Z2E2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mbd1Q9Z2E2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mbd1Q9Z2E2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mbd1Q9Z2E2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mbd1Q9Z2E2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mbd1Q9Z2E2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mbd1Q9Z2E2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mbd1Q9Z2E2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mbd1Q9Z2E2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mbd1Q9Z2E2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd1Q9Z2E2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd1Q9Z2E2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd1Q9Z2E2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd1Q9Z2E2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd1Q9Z2E2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd1Q9Z2E2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mbd1Q9Z2E2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd1Q9Z2E2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd1Q9Z2E2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mbd1Q9Z2E2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd1Q9Z2E2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms