Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D6

Mecp2, Methyl-CpG-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mecp2Q9Z2D6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mecp2Q9Z2D6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mecp2Q9Z2D6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mecp2Q9Z2D6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mecp2Q9Z2D6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mecp2Q9Z2D6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mecp2Q9Z2D6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mecp2Q9Z2D6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mecp2Q9Z2D6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mecp2Q9Z2D6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mecp2Q9Z2D6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mecp2Q9Z2D6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mecp2Q9Z2D6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mecp2Q9Z2D6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mecp2Q9Z2D6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mecp2Q9Z2D6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mecp2Q9Z2D6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mecp2Q9Z2D6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mecp2Q9Z2D6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mecp2Q9Z2D6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mecp2Q9Z2D6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mecp2Q9Z2D6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mecp2Q9Z2D6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Mecp2Q9Z2D6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Mecp2Q9Z2D6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mecp2Q9Z2D6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mecp2Q9Z2D6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mecp2Q9Z2D6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mecp2Q9Z2D6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mecp2Q9Z2D6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mecp2Q9Z2D6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Mecp2Q9Z2D6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mecp2Q9Z2D6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mecp2Q9Z2D6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mecp2Q9Z2D6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms