Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S3

Rasgrp1, RAS guanyl-releasing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrp1Q9Z1S3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rasgrp1Q9Z1S3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rasgrp1Q9Z1S3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rasgrp1Q9Z1S3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rasgrp1Q9Z1S3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rasgrp1Q9Z1S3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rasgrp1Q9Z1S3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rasgrp1Q9Z1S3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rasgrp1Q9Z1S3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rasgrp1Q9Z1S3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rasgrp1Q9Z1S3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rasgrp1Q9Z1S3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rasgrp1Q9Z1S3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasgrp1Q9Z1S3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rasgrp1Q9Z1S3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rasgrp1Q9Z1S3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rasgrp1Q9Z1S3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rasgrp1Q9Z1S3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rasgrp1Q9Z1S3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rasgrp1Q9Z1S3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rasgrp1Q9Z1S3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rasgrp1Q9Z1S3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rasgrp1Q9Z1S3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rasgrp1Q9Z1S3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rasgrp1Q9Z1S3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rasgrp1Q9Z1S3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rasgrp1Q9Z1S3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rasgrp1Q9Z1S3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rasgrp1Q9Z1S3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rasgrp1Q9Z1S3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rasgrp1Q9Z1S3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rasgrp1Q9Z1S3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rasgrp1Q9Z1S3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rasgrp1Q9Z1S3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rasgrp1Q9Z1S3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rasgrp1Q9Z1S3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rasgrp1Q9Z1S3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rasgrp1Q9Z1S3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rasgrp1Q9Z1S3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rasgrp1Q9Z1S3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rasgrp1Q9Z1S3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rasgrp1Q9Z1S3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rasgrp1Q9Z1S3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rasgrp1Q9Z1S3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rasgrp1Q9Z1S3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rasgrp1Q9Z1S3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rasgrp1Q9Z1S3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rasgrp1Q9Z1S3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rasgrp1Q9Z1S3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rasgrp1Q9Z1S3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rasgrp1Q9Z1S3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rasgrp1Q9Z1S3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rasgrp1Q9Z1S3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rasgrp1Q9Z1S3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rasgrp1Q9Z1S3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rasgrp1Q9Z1S3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rasgrp1Q9Z1S3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rasgrp1Q9Z1S3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rasgrp1Q9Z1S3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms