Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfrp4Q9Z1N6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sfrp4Q9Z1N6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sfrp4Q9Z1N6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sfrp4Q9Z1N6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms