Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1F6

Cnmd, Leukocyte cell-derived chemotaxin 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnmdQ9Z1F6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CnmdQ9Z1F6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CnmdQ9Z1F6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CnmdQ9Z1F6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CnmdQ9Z1F6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CnmdQ9Z1F6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CnmdQ9Z1F6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CnmdQ9Z1F6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CnmdQ9Z1F6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CnmdQ9Z1F6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CnmdQ9Z1F6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CnmdQ9Z1F6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CnmdQ9Z1F6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CnmdQ9Z1F6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CnmdQ9Z1F6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CnmdQ9Z1F6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CnmdQ9Z1F6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms