Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Padi1Q9Z185 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Padi1Q9Z185 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Padi1Q9Z185 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Padi1Q9Z185 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Padi1Q9Z185 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Padi1Q9Z185 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Padi1Q9Z185 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Padi1Q9Z185 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Padi1Q9Z185 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Padi1Q9Z185 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Padi1Q9Z185 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Padi1Q9Z185 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Padi1Q9Z185 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Padi1Q9Z185 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Padi1Q9Z185 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Padi1Q9Z185 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Padi1Q9Z185 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Padi1Q9Z185 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Padi1Q9Z185 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Padi1Q9Z185 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Padi1Q9Z185 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Padi1Q9Z185 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Padi1Q9Z185 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Padi1Q9Z185 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Padi1Q9Z185 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Padi1Q9Z185 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Padi1Q9Z185 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Padi1Q9Z185 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Padi1Q9Z185 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Padi1Q9Z185 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Padi1Q9Z185 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Padi1Q9Z185 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Padi1Q9Z185 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Padi1Q9Z185 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms