Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nr1h3Q9Z0Y9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Nr1h3Q9Z0Y9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nr1h3Q9Z0Y9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nr1h3Q9Z0Y9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nr1h3Q9Z0Y9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nr1h3Q9Z0Y9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nr1h3Q9Z0Y9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nr1h3Q9Z0Y9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nr1h3Q9Z0Y9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nr1h3Q9Z0Y9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr1h3Q9Z0Y9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr1h3Q9Z0Y9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nr1h3Q9Z0Y9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nr1h3Q9Z0Y9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nr1h3Q9Z0Y9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nr1h3Q9Z0Y9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nr1h3Q9Z0Y9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr1h3Q9Z0Y9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nr1h3Q9Z0Y9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr1h3Q9Z0Y9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr1h3Q9Z0Y9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nr1h3Q9Z0Y9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nr1h3Q9Z0Y9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr1h3Q9Z0Y9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr1h3Q9Z0Y9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nr1h3Q9Z0Y9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nr1h3Q9Z0Y9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nr1h3Q9Z0Y9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nr1h3Q9Z0Y9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nr1h3Q9Z0Y9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nr1h3Q9Z0Y9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nr1h3Q9Z0Y9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nr1h3Q9Z0Y9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nr1h3Q9Z0Y9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms