Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn9Q9Z0S7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn9Q9Z0S7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn9Q9Z0S7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn9Q9Z0S7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn9Q9Z0S7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn9Q9Z0S7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn9Q9Z0S7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn9Q9Z0S7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cldn9Q9Z0S7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn9Q9Z0S7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn9Q9Z0S7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn9Q9Z0S7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn9Q9Z0S7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.9 ms