Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stub1Q9WUD1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stub1Q9WUD1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stub1Q9WUD1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stub1Q9WUD1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stub1Q9WUD1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stub1Q9WUD1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stub1Q9WUD1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stub1Q9WUD1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stub1Q9WUD1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stub1Q9WUD1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stub1Q9WUD1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stub1Q9WUD1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stub1Q9WUD1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Stub1Q9WUD1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stub1Q9WUD1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stub1Q9WUD1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stub1Q9WUD1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stub1Q9WUD1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stub1Q9WUD1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Stub1Q9WUD1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Stub1Q9WUD1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stub1Q9WUD1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stub1Q9WUD1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stub1Q9WUD1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Stub1Q9WUD1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stub1Q9WUD1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stub1Q9WUD1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stub1Q9WUD1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stub1Q9WUD1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stub1Q9WUD1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stub1Q9WUD1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stub1Q9WUD1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Stub1Q9WUD1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stub1Q9WUD1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Stub1Q9WUD1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms