Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB0

Rbck1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbck1Q9WUB0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Rbck1Q9WUB0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Rbck1Q9WUB0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Rbck1Q9WUB0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Rbck1Q9WUB0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Rbck1Q9WUB0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Rbck1Q9WUB0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Rbck1Q9WUB0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Rbck1Q9WUB0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Rbck1Q9WUB0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Rbck1Q9WUB0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Rbck1Q9WUB0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Rbck1Q9WUB0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Rbck1Q9WUB0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Rbck1Q9WUB0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23,45■■□□□ 1,35
Rbck1Q9WUB0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23,44■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Rbck1Q9WUB0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Rbck1Q9WUB0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Rbck1Q9WUB0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Rbck1Q9WUB0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23,38■■□□□ 1,33
Rbck1Q9WUB0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Rbck1Q9WUB0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Rbck1Q9WUB0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Rbck1Q9WUB0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Rbck1Q9WUB0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Rbck1Q9WUB0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Rbck1Q9WUB0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Rbck1Q9WUB0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Rbck1Q9WUB0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Rbck1Q9WUB0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Rbck1Q9WUB0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Rbck1Q9WUB0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Rbck1Q9WUB0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Rbck1Q9WUB0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Rbck1Q9WUB0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Rbck1Q9WUB0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Rbck1Q9WUB0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Rbck1Q9WUB0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Rbck1Q9WUB0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Rbck1Q9WUB0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Rbck1Q9WUB0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23,27■■□□□ 1,32
Rbck1Q9WUB0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Rbck1Q9WUB0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Rbck1Q9WUB0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms