Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU66

Sfrp5, Secreted frizzled-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp5Q9WU66 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfrp5Q9WU66 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sfrp5Q9WU66 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sfrp5Q9WU66 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sfrp5Q9WU66 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sfrp5Q9WU66 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms