Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scnn1gQ9WU39 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Scnn1gQ9WU39 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Scnn1gQ9WU39 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Scnn1gQ9WU39 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1gQ9WU39 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1gQ9WU39 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1gQ9WU39 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Scnn1gQ9WU39 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Scnn1gQ9WU39 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Scnn1gQ9WU39 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Scnn1gQ9WU39 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scnn1gQ9WU39 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Scnn1gQ9WU39 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1gQ9WU39 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Scnn1gQ9WU39 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scnn1gQ9WU39 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scnn1gQ9WU39 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scnn1gQ9WU39 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scnn1gQ9WU39 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scnn1gQ9WU39 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scnn1gQ9WU39 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Scnn1gQ9WU39 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scnn1gQ9WU39 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scnn1gQ9WU39 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scnn1gQ9WU39 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scnn1gQ9WU39 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scnn1gQ9WU39 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scnn1gQ9WU39 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scnn1gQ9WU39 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scnn1gQ9WU39 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scnn1gQ9WU39 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scnn1gQ9WU39 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scnn1gQ9WU39 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Scnn1gQ9WU39 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Scnn1gQ9WU39 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Scnn1gQ9WU39 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Scnn1gQ9WU39 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scnn1gQ9WU39 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scnn1gQ9WU39 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms