Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scn8aQ9WTU3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scn8aQ9WTU3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scn8aQ9WTU3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scn8aQ9WTU3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn8aQ9WTU3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn8aQ9WTU3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scn8aQ9WTU3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scn8aQ9WTU3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scn8aQ9WTU3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scn8aQ9WTU3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scn8aQ9WTU3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Scn8aQ9WTU3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scn8aQ9WTU3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scn8aQ9WTU3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scn8aQ9WTU3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn8aQ9WTU3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn8aQ9WTU3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scn8aQ9WTU3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn8aQ9WTU3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn8aQ9WTU3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scn8aQ9WTU3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn8aQ9WTU3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn8aQ9WTU3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn8aQ9WTU3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scn8aQ9WTU3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scn8aQ9WTU3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Scn8aQ9WTU3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scn8aQ9WTU3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn8aQ9WTU3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn8aQ9WTU3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scn8aQ9WTU3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scn8aQ9WTU3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn8aQ9WTU3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn8aQ9WTU3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn8aQ9WTU3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn8aQ9WTU3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn8aQ9WTU3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn8aQ9WTU3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scn8aQ9WTU3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scn8aQ9WTU3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scn8aQ9WTU3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn8aQ9WTU3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn8aQ9WTU3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scn8aQ9WTU3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn8aQ9WTU3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn8aQ9WTU3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Scn8aQ9WTU3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn8aQ9WTU3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scn8aQ9WTU3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn8aQ9WTU3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn8aQ9WTU3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Scn8aQ9WTU3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scn8aQ9WTU3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn8aQ9WTU3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scn8aQ9WTU3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scn8aQ9WTU3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn8aQ9WTU3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn8aQ9WTU3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scn8aQ9WTU3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scn8aQ9WTU3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scn8aQ9WTU3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms