Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Scn8aQ9WTU3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Scn8aQ9WTU3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24,76■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,55
Scn8aQ9WTU3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Scn8aQ9WTU3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Scn8aQ9WTU3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Scn8aQ9WTU3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24,68■■□□□ 1,54
Scn8aQ9WTU3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Scn8aQ9WTU3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Scn8aQ9WTU3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Scn8aQ9WTU3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24,66■■□□□ 1,54
Scn8aQ9WTU3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24,65■■□□□ 1,54
Scn8aQ9WTU3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Scn8aQ9WTU3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Scn8aQ9WTU3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Scn8aQ9WTU3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Scn8aQ9WTU3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Scn8aQ9WTU3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Scn8aQ9WTU3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Scn8aQ9WTU3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Scn8aQ9WTU3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Scn8aQ9WTU3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Scn8aQ9WTU3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Scn8aQ9WTU3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Scn8aQ9WTU3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Scn8aQ9WTU3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Scn8aQ9WTU3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24,58■■□□□ 1,52
Scn8aQ9WTU3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Scn8aQ9WTU3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Scn8aQ9WTU3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Scn8aQ9WTU3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Scn8aQ9WTU3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Scn8aQ9WTU3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Scn8aQ9WTU3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Scn8aQ9WTU3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Scn8aQ9WTU3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Scn8aQ9WTU3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Scn8aQ9WTU3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Scn8aQ9WTU3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Scn8aQ9WTU3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Scn8aQ9WTU3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,5■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24,47■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,45■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,45■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Scn8aQ9WTU3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Scn8aQ9WTU3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Scn8aQ9WTU3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Scn8aQ9WTU3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Scn8aQ9WTU3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Scn8aQ9WTU3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24,44■■□□□ 1,5
Scn8aQ9WTU3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Scn8aQ9WTU3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Scn8aQ9WTU3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24,42■■□□□ 1,5
Scn8aQ9WTU3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Scn8aQ9WTU3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24,42■■□□□ 1,5
Scn8aQ9WTU3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Scn8aQ9WTU3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Scn8aQ9WTU3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Scn8aQ9WTU3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Scn8aQ9WTU3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Scn8aQ9WTU3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Scn8aQ9WTU3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Scn8aQ9WTU3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Scn8aQ9WTU3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Scn8aQ9WTU3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24,36■■□□□ 1,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms