Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Psma1Q9R1P4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psma1Q9R1P4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psma1Q9R1P4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psma1Q9R1P4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma1Q9R1P4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms