Protein–RNA interactions for Protein: Q9R187

Edar, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdarQ9R187 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EdarQ9R187 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
EdarQ9R187 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
EdarQ9R187 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EdarQ9R187 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
EdarQ9R187 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EdarQ9R187 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EdarQ9R187 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EdarQ9R187 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EdarQ9R187 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms