Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc26a4Q9R155 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc26a4Q9R155 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slc26a4Q9R155 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc26a4Q9R155 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc26a4Q9R155 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc26a4Q9R155 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc26a4Q9R155 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc26a4Q9R155 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc26a4Q9R155 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc26a4Q9R155 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc26a4Q9R155 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc26a4Q9R155 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc26a4Q9R155 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Slc26a4Q9R155 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc26a4Q9R155 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc26a4Q9R155 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc26a4Q9R155 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc26a4Q9R155 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc26a4Q9R155 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc26a4Q9R155 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc26a4Q9R155 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc26a4Q9R155 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc26a4Q9R155 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc26a4Q9R155 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc26a4Q9R155 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc26a4Q9R155 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc26a4Q9R155 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc26a4Q9R155 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc26a4Q9R155 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc26a4Q9R155 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc26a4Q9R155 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc26a4Q9R155 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc26a4Q9R155 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc26a4Q9R155 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc26a4Q9R155 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc26a4Q9R155 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc26a4Q9R155 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Slc26a4Q9R155 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc26a4Q9R155 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc26a4Q9R155 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Slc26a4Q9R155 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc26a4Q9R155 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc26a4Q9R155 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc26a4Q9R155 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc26a4Q9R155 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc26a4Q9R155 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc26a4Q9R155 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Slc26a4Q9R155 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc26a4Q9R155 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Slc26a4Q9R155 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slc26a4Q9R155 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slc26a4Q9R155 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slc26a4Q9R155 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc26a4Q9R155 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc26a4Q9R155 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc26a4Q9R155 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Slc26a4Q9R155 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc26a4Q9R155 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slc26a4Q9R155 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Slc26a4Q9R155 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc26a4Q9R155 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc26a4Q9R155 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc26a4Q9R155 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc26a4Q9R155 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc26a4Q9R155 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc26a4Q9R155 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms