Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tpk1Q9R0M5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tpk1Q9R0M5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpk1Q9R0M5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpk1Q9R0M5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpk1Q9R0M5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms