Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphs1Q9QZS7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphs1Q9QZS7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphs1Q9QZS7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphs1Q9QZS7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nphs1Q9QZS7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphs1Q9QZS7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphs1Q9QZS7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nphs1Q9QZS7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphs1Q9QZS7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphs1Q9QZS7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nphs1Q9QZS7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphs1Q9QZS7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nphs1Q9QZS7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nphs1Q9QZS7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nphs1Q9QZS7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nphs1Q9QZS7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nphs1Q9QZS7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nphs1Q9QZS7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nphs1Q9QZS7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphs1Q9QZS7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphs1Q9QZS7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nphs1Q9QZS7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphs1Q9QZS7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphs1Q9QZS7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphs1Q9QZS7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphs1Q9QZS7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nphs1Q9QZS7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nphs1Q9QZS7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nphs1Q9QZS7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nphs1Q9QZS7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nphs1Q9QZS7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.8 ms