Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcf1Q9QZM3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcf1Q9QZM3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcf1Q9QZM3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcf1Q9QZM3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcf1Q9QZM3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcf1Q9QZM3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcf1Q9QZM3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcf1Q9QZM3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcf1Q9QZM3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcf1Q9QZM3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcf1Q9QZM3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcf1Q9QZM3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcf1Q9QZM3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcf1Q9QZM3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcf1Q9QZM3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcf1Q9QZM3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcf1Q9QZM3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clcf1Q9QZM3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcf1Q9QZM3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Clcf1Q9QZM3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Clcf1Q9QZM3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Clcf1Q9QZM3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Clcf1Q9QZM3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms