Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Bcl11aQ9QYE3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Bcl11aQ9QYE3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Bcl11aQ9QYE3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Bcl11aQ9QYE3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Bcl11aQ9QYE3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Bcl11aQ9QYE3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Bcl11aQ9QYE3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms