Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ6

Slco1a1, Solute carrier organic anion transporter family member 1A1, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1a1Q9QXZ6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slco1a1Q9QXZ6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slco1a1Q9QXZ6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slco1a1Q9QXZ6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slco1a1Q9QXZ6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slco1a1Q9QXZ6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slco1a1Q9QXZ6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slco1a1Q9QXZ6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slco1a1Q9QXZ6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slco1a1Q9QXZ6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slco1a1Q9QXZ6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slco1a1Q9QXZ6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slco1a1Q9QXZ6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slco1a1Q9QXZ6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slco1a1Q9QXZ6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slco1a1Q9QXZ6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slco1a1Q9QXZ6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slco1a1Q9QXZ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slco1a1Q9QXZ6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slco1a1Q9QXZ6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slco1a1Q9QXZ6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slco1a1Q9QXZ6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slco1a1Q9QXZ6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slco1a1Q9QXZ6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slco1a1Q9QXZ6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slco1a1Q9QXZ6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slco1a1Q9QXZ6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slco1a1Q9QXZ6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slco1a1Q9QXZ6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slco1a1Q9QXZ6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slco1a1Q9QXZ6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slco1a1Q9QXZ6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slco1a1Q9QXZ6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slco1a1Q9QXZ6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slco1a1Q9QXZ6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms