Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Copg2Q9QXK3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Copg2Q9QXK3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Copg2Q9QXK3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Copg2Q9QXK3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Copg2Q9QXK3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Copg2Q9QXK3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Copg2Q9QXK3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Copg2Q9QXK3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Copg2Q9QXK3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Copg2Q9QXK3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Copg2Q9QXK3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Copg2Q9QXK3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copg2Q9QXK3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copg2Q9QXK3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copg2Q9QXK3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Copg2Q9QXK3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copg2Q9QXK3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Copg2Q9QXK3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Copg2Q9QXK3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Copg2Q9QXK3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copg2Q9QXK3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copg2Q9QXK3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Copg2Q9QXK3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Copg2Q9QXK3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Copg2Q9QXK3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Copg2Q9QXK3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copg2Q9QXK3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copg2Q9QXK3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Copg2Q9QXK3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copg2Q9QXK3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copg2Q9QXK3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Copg2Q9QXK3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Copg2Q9QXK3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copg2Q9QXK3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Copg2Q9QXK3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Copg2Q9QXK3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copg2Q9QXK3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copg2Q9QXK3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copg2Q9QXK3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Copg2Q9QXK3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Copg2Q9QXK3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Copg2Q9QXK3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms