Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Dpf1Q9QX66 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Dpf1Q9QX66 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Dpf1Q9QX66 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Dpf1Q9QX66 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Dpf1Q9QX66 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Dpf1Q9QX66 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Dpf1Q9QX66 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Dpf1Q9QX66 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Dpf1Q9QX66 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Dpf1Q9QX66 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Dpf1Q9QX66 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Dpf1Q9QX66 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Dpf1Q9QX66 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Dpf1Q9QX66 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Dpf1Q9QX66 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Dpf1Q9QX66 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Dpf1Q9QX66 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Dpf1Q9QX66 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Dpf1Q9QX66 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dpf1Q9QX66 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Dpf1Q9QX66 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Dpf1Q9QX66 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Dpf1Q9QX66 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Dpf1Q9QX66 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Dpf1Q9QX66 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Dpf1Q9QX66 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Dpf1Q9QX66 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Dpf1Q9QX66 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Dpf1Q9QX66 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Dpf1Q9QX66 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Dpf1Q9QX66 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Dpf1Q9QX66 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Dpf1Q9QX66 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Dpf1Q9QX66 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Dpf1Q9QX66 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Dpf1Q9QX66 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Dpf1Q9QX66 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Dpf1Q9QX66 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Dpf1Q9QX66 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Dpf1Q9QX66 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Dpf1Q9QX66 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Dpf1Q9QX66 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Dpf1Q9QX66 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Dpf1Q9QX66 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Dpf1Q9QX66 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Dpf1Q9QX66 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Dpf1Q9QX66 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Dpf1Q9QX66 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Dpf1Q9QX66 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Dpf1Q9QX66 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Dpf1Q9QX66 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Dpf1Q9QX66 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Dpf1Q9QX66 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Dpf1Q9QX66 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Dpf1Q9QX66 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Dpf1Q9QX66 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Dpf1Q9QX66 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Dpf1Q9QX66 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Dpf1Q9QX66 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Dpf1Q9QX66 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Dpf1Q9QX66 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Dpf1Q9QX66 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Dpf1Q9QX66 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Dpf1Q9QX66 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Dpf1Q9QX66 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Dpf1Q9QX66 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Dpf1Q9QX66 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Dpf1Q9QX66 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Dpf1Q9QX66 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Dpf1Q9QX66 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Dpf1Q9QX66 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Dpf1Q9QX66 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Dpf1Q9QX66 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Dpf1Q9QX66 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Dpf1Q9QX66 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Dpf1Q9QX66 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Dpf1Q9QX66 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Dpf1Q9QX66 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Dpf1Q9QX66 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Dpf1Q9QX66 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Dpf1Q9QX66 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Dpf1Q9QX66 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Dpf1Q9QX66 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Dpf1Q9QX66 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Dpf1Q9QX66 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Dpf1Q9QX66 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Dpf1Q9QX66 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Dpf1Q9QX66 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Dpf1Q9QX66 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Dpf1Q9QX66 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Dpf1Q9QX66 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Dpf1Q9QX66 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Dpf1Q9QX66 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Dpf1Q9QX66 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Dpf1Q9QX66 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Dpf1Q9QX66 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dpf1Q9QX66 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Dpf1Q9QX66 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Dpf1Q9QX66 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms