Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Homer2Q9QWW1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Homer2Q9QWW1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Homer2Q9QWW1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Homer2Q9QWW1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Homer2Q9QWW1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Homer2Q9QWW1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Homer2Q9QWW1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Homer2Q9QWW1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Homer2Q9QWW1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Homer2Q9QWW1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Homer2Q9QWW1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Homer2Q9QWW1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Homer2Q9QWW1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Homer2Q9QWW1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Homer2Q9QWW1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Homer2Q9QWW1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Homer2Q9QWW1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Homer2Q9QWW1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Homer2Q9QWW1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Homer2Q9QWW1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Homer2Q9QWW1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Homer2Q9QWW1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Homer2Q9QWW1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Homer2Q9QWW1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Homer2Q9QWW1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Homer2Q9QWW1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Homer2Q9QWW1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Homer2Q9QWW1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Homer2Q9QWW1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Homer2Q9QWW1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Homer2Q9QWW1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Homer2Q9QWW1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Homer2Q9QWW1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Homer2Q9QWW1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Homer2Q9QWW1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Homer2Q9QWW1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Homer2Q9QWW1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Homer2Q9QWW1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Homer2Q9QWW1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Homer2Q9QWW1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Homer2Q9QWW1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Homer2Q9QWW1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Homer2Q9QWW1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Homer2Q9QWW1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Homer2Q9QWW1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Homer2Q9QWW1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Homer2Q9QWW1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Homer2Q9QWW1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms