Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vstm2bQ9JME9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vstm2bQ9JME9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vstm2bQ9JME9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vstm2bQ9JME9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vstm2bQ9JME9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vstm2bQ9JME9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vstm2bQ9JME9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vstm2bQ9JME9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vstm2bQ9JME9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vstm2bQ9JME9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm2bQ9JME9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm2bQ9JME9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm2bQ9JME9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm2bQ9JME9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm2bQ9JME9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm2bQ9JME9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm2bQ9JME9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vstm2bQ9JME9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vstm2bQ9JME9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vstm2bQ9JME9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vstm2bQ9JME9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vstm2bQ9JME9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vstm2bQ9JME9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vstm2bQ9JME9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vstm2bQ9JME9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vstm2bQ9JME9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vstm2bQ9JME9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vstm2bQ9JME9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vstm2bQ9JME9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vstm2bQ9JME9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vstm2bQ9JME9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vstm2bQ9JME9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vstm2bQ9JME9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vstm2bQ9JME9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vstm2bQ9JME9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vstm2bQ9JME9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vstm2bQ9JME9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vstm2bQ9JME9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vstm2bQ9JME9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vstm2bQ9JME9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vstm2bQ9JME9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vstm2bQ9JME9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vstm2bQ9JME9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Vstm2bQ9JME9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vstm2bQ9JME9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vstm2bQ9JME9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vstm2bQ9JME9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vstm2bQ9JME9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vstm2bQ9JME9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vstm2bQ9JME9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vstm2bQ9JME9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vstm2bQ9JME9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm2bQ9JME9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm2bQ9JME9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm2bQ9JME9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm2bQ9JME9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm2bQ9JME9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vstm2bQ9JME9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vstm2bQ9JME9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vstm2bQ9JME9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms