Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaja4Q9JMC3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnaja4Q9JMC3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaja4Q9JMC3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaja4Q9JMC3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaja4Q9JMC3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnaja4Q9JMC3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnaja4Q9JMC3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaja4Q9JMC3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaja4Q9JMC3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaja4Q9JMC3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnaja4Q9JMC3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnaja4Q9JMC3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnaja4Q9JMC3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Dnaja4Q9JMC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnaja4Q9JMC3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnaja4Q9JMC3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnaja4Q9JMC3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaja4Q9JMC3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnaja4Q9JMC3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaja4Q9JMC3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaja4Q9JMC3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaja4Q9JMC3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaja4Q9JMC3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnaja4Q9JMC3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaja4Q9JMC3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaja4Q9JMC3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnaja4Q9JMC3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnaja4Q9JMC3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnaja4Q9JMC3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnaja4Q9JMC3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnaja4Q9JMC3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnaja4Q9JMC3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnaja4Q9JMC3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaja4Q9JMC3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.5 ms